生物除磷系统是生活污水处理现场比较常见的工艺之一，也是比较传统的工艺，但也因此，污水处理会受到很多因素的影响导致效果不理想。
废水中总磷超标主要原因是进水磷酸盐浓度增加或污水系统中污泥重新释出总磷，导致总磷超标排放。
建议采用"化学除磷药剂"，通过投加药剂形成不溶性的磷酸盐沉淀物，然后通过固液分离将磷从污水中除去。
1、污泥负荷于污泥龄
厌氧-好氧生物除磷工艺是一种高F/M低SRT系统。
当F/M较高，SRT较低时，2号站登录剩余污泥排放量也就较多。
因而，在污泥含磷量一定的条件下，除磷量也就越多，除磷效果越好。
对于以除磷为主要目的生物系统，通常F/M为0.4～0.7kgBOD/kgMLSS•d，SRT为3.5～7d。
但是，SRT也不能太低，必1须以保证BOD5的有效去除为前提。
2、BOD/TP
要保证除磷效果，应控制进入厌氧区的污水中BOD/TP大于20。
由于聚磷酸菌属不动菌属，2号站登陆其生理活动较弱，只能摄取有机物中极易分解的部分。
因此，进水中应保证BOD5的含量，确保聚磷酸菌正常的生理代谢。
但许多城市污水处理厂实际进水存在碳源偏低，氮、磷等浓度较高等现象，导致BOD5/TP值无法满足生物除磷的需要，影响了生物除磷的效果。
3、溶解氧
厌氧区应保持严格厌氧状态，即溶解氧低于0.2mg/L，此时聚磷菌才能进行磷的有效释放，以保证后续处理效果。
而好氧区的溶解氧需保持在2.0mg/L以上，聚磷菌才能有效吸磷。因此，对于厌氧区和好氧区溶解氧的控制不当，将会极1大影响生物除磷的效果。
